IPB

Министерство здравоохранения Российской Федерации
Государственное образовательное учреждение
высшего профессионального образования

Волгоградский государственный

медицинский университет

IPB

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

2 страниц V   1 2 >  
Добавить ответ в эту темуОткрыть тему
> Биохимия: в помощь студенту
vzaytsev
сообщение 9.10.2006, 10:25
Сообщение #1


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Регулирование ферментативной активности в клетке

Так, поскольку в Северине раздел по регуляции и ингибированию написан из рук вон плохо, в предверии итоговой привожу список основных способов регуляции ферментативной активности:

1. внешними условиями (физическими и физико-химическими) протекания реакции ( в организме - преимущественно, за счет изменения рН)
2. концентрацией (доступностью_ субстрата
3.концентрацией продукта
4. доступностью кофактора (кофермента)
5. количеством фермента (определяется соотношением скоростей биосинтеза de novo и распада)
6. неаллостерическими ингибиторами
6а. обратимыми ингибиторами
- конкурентыми
- неконкурентными ("чистыми" и смешанными)
- бесконкурентыми
6б. необратимыми ингибиторами
например, реакционноспособными аналогами субстрата или "суицидальными субстратами"
7. аллостерическими регуляторами
7а. снижение активности
7б. повышение активности
7в. изменение субстратной специфичности
8. протеолитическим расщеплением (ограниченным протеолизом, м.б. как активация, так и инактивация)
9. ковалентной модификацией (по крайней мере знать про: фосфорилирование и дефосфорилирование, метилирование, ацилирование /в т.ч. ацетилирование/, нуклеотидилирование /в частности, АДФ-рибозилирование/, убихитинилирование)
10. взаимодействием с регуляторными белками (ассоциацией и диссоциацией ферментного комплекса)
11. взаимодействием с биологическими мембранами

Подробности сами в книжках найдете?


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 11.4.2007, 10:26
Сообщение #2


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Слайды к лекции "Биохимия стероидных гормонов". Немного больше 4 мегабайт

http://www.volgmed.ru/depts/biochem/sources/steroids.pps


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
Протей
сообщение 13.12.2007, 16:21
Сообщение #3


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 1 204
Факультет: ***
Статус: преподаватель
ICQ: 278118292


Цикл Кребса: образование цитрата...
в swf формате, для наглядности.
Прикрепленные файлы
Прикрепленный файл  CTA1r.swf ( 17.93 килобайт ) Кол-во скачиваний: 29
 


--------------------
Трудное это дело - жить в глубине и быть женатым человеком. (Лабиринт отражений)


Спасибо сказали:
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
Eraser
сообщение 13.12.2007, 18:55
Сообщение #4


полиция Кармы
****
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 616
Факультет: МБФ
Статус: ***



Цикл Кребса: механизм образования цитрата...
в чёрно-белом tiff формате, из книжки.
Прикрепленный файл  CSM.rar ( 54.36 килобайт ) Кол-во скачиваний: 20


Протей, спасибо, что реанимировали тему.


--------------------
Be thankful for what you got.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
insie
сообщение 16.12.2007, 12:29
Сообщение #5


Новичок
*
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3
Факультет: general practice
Статус: абитуриент



Не подскажете, где можно качнуть Д. Мецлер - Биохимия.
Желательно последней редакции (кажется только на английском, но это не страшно) и в формате pdf?
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 17.12.2007, 12:07
Сообщение #6


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Цитата(insie @ 16.12.2007, 12:29) *
Не подскажете, где можно качнуть Д. Мецлер - Биохимия.
Желательно последней редакции (кажется только на английском, но это не страшно) и в формате pdf?

http://ifolder.ru/4592850
http://ifolder.ru/4593083



--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 18.7.2009, 11:16
Сообщение #7


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


В блоге Юрия Кореновского (из Алтайского госмедуниверситета) есть раздел "Лекции" с конспектами некоторого числа лекций по биохимии
http://korenovsky.blogspot.com/


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 10.9.2009, 13:45
Сообщение #8


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Первый из давно задуманных проектов в помощь при изучении биохимии. Назовем пока его условно - Биохимия день за днем. Посты будут короткими, зато почти каждодневными. Первый пост - о значении современной биохимии для современной медицины.

Цитата
Какие же возможности дает понимание молекулярных причин и механизмов развития заболеваний?

1. Однозначно или с высокой вероятностью подтверждать диагноз заболевания и выявлять патологии еще до появления видимых признаков болезни (в том числе речь идет о пренатальной диагностике - обнаружении заболевания у еще не рожденного плода).

2. Разрабатывать способы лечения и непосредственно лечить пациента, воздействуя на причину его страданий, а не путем только устранения симптомов заболевания.

3. Целенаправленно создавать новые, более эффективные лекарства и нефармакологические методы лечения.

4. Предсказывать вероятность развития той или иной болезни у конкретного человека в будущем.

5. Принципиально изменить принципы профилактической медицины - на основе оценки степени персонального риска развития заболеваний можно будет перейти от "среднестатистических" программ предупреждения ряда заболеваний к профилактике персонифицированной.

6. Оценивать (обобщенно, так сказать вероятностно) наличие каких сочетанных патологий у пациента способно модифицировать эффект лечения основного заболевания и может повлиять.

7. Персонально оценивать вероятную эффективность лечения пациента с использованием лабораторных тестов (в идеале - еще до начала лечения) и осуществлять индивидальный подбор дозы используемых лекарственных препаратов.
(Подробный пост по ссылкам ниже)

Обсудить, дополнить, подискутировать, высказать свое мнение, задать вопрос и т.п. можно на одном из блогов, указанных далее. Поскольку комментарии доступны только для зарегистрированных пользователей соответствующих ресурсов, выбирайте себе сами, какой Вам по душе.
http://inview0.livejournal.com/3773.html
http://rubiomed.blogspot.com/2009/09/blog-post.html
http://elementy.ru/blogs/users/vzaitsev/41538/

В завтрашнем посте поговорим о месте биохимии среди наук о живом.


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 11.9.2009, 8:16
Сообщение #9


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Что изучает биохимия? (фон проблемы)
http://inview0.livejournal.com/3941.html
http://rubiomed.blogspot.com/2009/09/blog-post_11.html
http://elementy.ru/blogs/users/vzaitsev/41546/


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 22.9.2009, 13:22
Сообщение #10


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Цитата
БИОХИМИЯ – наука, которая изучает химический состав биологических объектов и протекающие в живых организмах химические реакции и процессы в их взаимосвязи между собой и с функционированием организма.
Рассуждения - на блогах.


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 30.9.2009, 12:55
Сообщение #11


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Для 5 курса МБФ: Свободнорадикальная медицина (слайды к лекции)
http://edu.volgmed.ru/mod/resource/view.php?id=695


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev


Спасибо сказали:
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
Протей
сообщение 1.10.2009, 8:46
Сообщение #12


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 1 204
Факультет: ***
Статус: преподаватель
ICQ: 278118292


Цитата
В этих реакциях образуются радикалы гидроксила HO. или липидов (LO. и другие).
Эти радикалы обладают разрушительным действием по отношению к нуклеиновым кислотам, белкам и мембранам

по слайду эти радикалы образуются из H2O2, HClO и LOOH под действием иона Fe2+.
на следующем слайде показано как гидроксил радикал вызывает разрыв нити ДНК.
учитывая, что время жизни гидроксил радикала по литературным данным 10 в минус 7 степени секунды возникает вопрос:
для того, чтобы HO* вызвал разрушительное действие на нить ДНК необходимо, чтобы H2O2 (или HClO) c Fe2+ должны находиться в непосредственной близости он нуклеиновой кислоты. какова концентрация этих компонентов в норме около ДНК. и как накапливаются они при патологии?
(с H2O2 вроде понятно, она незаряжена и способна диффундировать сквозь мембраны, а ионы железа?)


--------------------
Трудное это дело - жить в глубине и быть женатым человеком. (Лабиринт отражений)
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
Надюша
сообщение 6.10.2009, 21:39
Сообщение #13


Участник
***
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 162
Факультет: ***
Статус: ***



спасибо вам,что в методичке отметили статьи в Соросовском журнале!!
Читаю его-ну просто прелесть!так интересно написано!и главное,доступно!


--------------------
Дорогу осилит идущий.

Господи, дай мне сил изменить то, что я могу изменить, смирения принять то, что изменить невозможно, и мудрости отличить одно от другого.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 7.10.2009, 9:46
Сообщение #14


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Цитата(Протей @ 1.10.2009, 9:46) *
Цитата
В этих реакциях образуются радикалы гидроксила HO. или липидов (LO. и другие).
Эти радикалы обладают разрушительным действием по отношению к нуклеиновым кислотам, белкам и мембранам

по слайду эти радикалы образуются из H2O2, HClO и LOOH под действием иона Fe2+.
на следующем слайде показано как гидроксил радикал вызывает разрыв нити ДНК.
учитывая, что время жизни гидроксил радикала по литературным данным 10 в минус 7 степени секунды возникает вопрос:
для того, чтобы HO* вызвал разрушительное действие на нить ДНК необходимо, чтобы H2O2 (или HClO) c Fe2+ должны находиться в непосредственной близости он нуклеиновой кислоты. какова концентрация этих компонентов в норме около ДНК. и как накапливаются они при патологии?
(с H2O2 вроде понятно, она незаряжена и способна диффундировать сквозь мембраны, а ионы железа?)

Вот например:
Цитата
Labile iron pool (LIP) constitutes a crossroad of metabolic pathways of iron-containing compounds and is midway between the cellular need for iron, its uptake and storage. In this study we investigated oxidative DNA damage in relation to the labile iron pool in a pair of mouse lymphoma L5178Y (LY) sublines (LY-R and LY-S) differing in sensitivity to hydrogen peroxide. The LY-R cells, which are hydrogen peroxide-sensitive, contain 3 times more labile iron than the hydrogen peroxide-resistant LY-S cells. Using the comet assay, we compared total DNA breakage in the studied cell lines treated with hydrogen peroxide (25 mM for 30 min at 4°C). More DNA damage was found in LY-R cells than in LY-S cells. We also compared the levels of DNA lesions sensitive to specific DNA repair enzymes in both cell lines treated with H2O2. The levels of endonuclease III-sensitive sites and Fapy-DNA glycosylase-sensitive sites were found to be higher in LY-R cells than in LY-S cells
http://www.actabp.pl/pdf/1_2003/211s.pdf

Одним из обильных источников Fe в ядре может, в частности, являться белок хантингтин, присутствующий в норме в нейронах любого человека, но связанный с развитием известной болезни Хантингтона. Другой хорошо установленный источник: FeS-белки, которые встречаются не только в митохондриях, но также и в ядре и цитозоле. Кроме того, хорошо известно, что транспортеры двухвалентных металлов, вовлеченные в транспорт железа, обнаруживаются не только на цитоплазматической мембране, но и в ядре.


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev


Спасибо сказали:
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 24.10.2009, 11:49
Сообщение #15


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Эволюция как сопротивление энтропии
http://elementy.ru/lib/430413
Цитата
Эволюция — это способ живого противостоять энтропии, нарастающему хаосу и беспорядку. Она творит разные новшества, но естественный отбор сохраняет только те из них, что придают организмам устойчивость к дальнейшим изменениям, те, что позволяют им воспроизводить свои копии в длинном ряду поколений, практически не меняясь. Как это ни странно, но получается, что эволюция работает против себя самой.


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 5.12.2009, 10:40
Сообщение #16


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


CYBERLIPID CENTER
Весьма полезный ресурс для того, кто пытается разобраться в ида и свойствах липидов, и для, тех, кто с липидами экспериментально работает
http://www.cyberlipid.org/


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev


Спасибо сказали:
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 10.12.2009, 13:20
Сообщение #17


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Гельфанд: Что может биоинформатика
http://elementy.ru/lib/430895


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 19.1.2010, 15:22
Сообщение #18


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Интрактивные обучающие видео от Foundation for Genomics and Population Health
http://www.phgfoundation.org/tutorials/home/

Разделы:


* Introduction
* Penetrance
* ACCE
* Patents
* Moral Theories
* Pharmacogenomics
* DNA Test Methods
* Disease Susceptibility
* Twin Adoption Studies
* Informed Consent
* Clinical Utility


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 15.3.2010, 19:47
Сообщение #19


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


Про белки
http://www.friedli.com/herbs/phytochem/proteins.html
http://www.tulane.edu/~biochem/med/second.htm


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
vzaytsev
сообщение 16.4.2010, 21:28
Сообщение #20


Почётный
******
Вставить ник
Цитата

Сообщений: 3 594
Из: Волгоград
Факультет: *
Статус: преподаватель
ICQ: 491677109


А это просто интересно почитать
http://sandwalk.blogspot.com/


--------------------
Жизнь - это то, что случается с нами, пока мы строим планы на жизнь (Джон Леннон)
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
ORCID ID 0000-0001-9191-2862
http://www.facebook.com/valery.g.zaitsev
http://twitter.com/#!/valeryzaitsev
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения

2 страниц V   1 2 >
Добавить ответ в эту темуОткрыть тему
1 чел. читают эту тему (гостей: 1, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 



- Текстовая версия Сейчас: 16.7.2019, 7:12